O sistema para análise de raízes WinRHIZO, desenvolvido pela empresa canadense Regent Instruments, foi especialmente concebido para a medição das raízes em diferentes formas, podendo realizar análises morfológicas (comprimento, área, volume, número de pontas, bifurcações e cruzamentos). Na versão Pró é possível análises morfológicas em função do diâmetro e da cor, tais como: comprimento, área/volume e número de pontas.
Por possuir análise de cor, é possível o uso do sistema para medidas de área, quantificação de doenças e danos em folhas, medir raízes colocadas sobre fundo contrastante, análise morfológica da raiz em função da cor, quantificação de crescimento e micorrizas. A imagem pode ser captada com o uso de câmera fotográfica, e neste caso é necessário respeitar os procedimentos de preparo de amostra.